社会保険の手続きといえば、かつては紙の書類を用意して年金事務所や労働基準監督署に持参・郵送するのが一般的でした。しかし今では、freeeとe-Govを連携させることで、多くの手続きをオンライン上で完結させることができます。
この記事では、社会保険労務士法人とうかい(愛知・名古屋拠点)が、freeeの電子申請機能のメリット・デメリットと、スムーズな導入のポイントを解説します。
この記事の監修
社会保険労務士法人とうかい
社会保険労務士 小栗多喜子
これまで給与計算の部門でマネージャー職を担当。チームメンバーとともに常時顧問先450社以上の業務支援を行ってきた。加えて、chatworkやzoomを介し、労務のお悩み解決を迅速・きめ細やかにフォローアップ。
現在はその経験をいかして、社会保険労務士法人とうかいグループの採用・人材教育など、組織の成長に向けた人づくりを専任で担当。そのほかメディア、外部・内部のセミナー等で、スポットワーカーや社会保険の適用拡大など変わる人事労務の情報について広く発信している。
主な出演メディア
- NHK「あさイチ」
- 中日新聞
- 船井総研のYouTubeチャンネル「Funai online」
社会保険労務士 小栗多喜子のプロフィール紹介はこちら
https://www.tokai-sr.jp/staff/oguri/
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1. 紙申請 vs 電子申請:何が変わるのか
社会保険・労働保険の手続きは種類が非常に多く、入社・退社・扶養変更・産前産後休業・育児休業・算定基礎届など、年間を通じて頻繁に発生します。
紙申請の場合:
- 書類を手書きまたはExcelで作成
- 印刷・押印・郵送または窓口持参
- 受理されるまで状況が確認できない
- 書類の控えを手元で管理する必要がある

電子申請(freee+e-Gov)の場合:
- freee上でデータを入力→電子申請
- 申請状況をオンラインで追跡
- 控えデータはシステム上で管理
- 役所への往復がゼロに

この違いが、担当者の業務負担に大きな差を生みます。
2. freeeの電子申請(e-Gov連携)でできること
freeeは、政府が提供する電子申請システム「e-Gov」と連携しており、以下のような社会保険・労働保険の手続きをオンラインで行うことができます。
主な対応手続き(例)
- 健康保険・厚生年金保険の被保険者資格取得届・喪失届
- 扶養家族の異動届(被扶養者(異動)届)
- 算定基礎届・月額変更届
- 育児休業・産前産後休業に関する届出
- 雇用保険の資格取得届・喪失届
- 労働保険の年度更新

※対応手続きの範囲はfreeeのバージョン・契約プランにより異なります。最新情報はfreee公式サイトをご確認ください。
3. freee電子申請のメリット
メリット① 手続き時間の大幅短縮
役所への往復・郵送の待ち時間がなくなります。特に従業員の入退社が多い会社では、毎月の手続き工数が大きく削減できます。

メリット② ヒューマンエラーの削減
freee上の従業員データ(氏名・住所・生年月日・報酬額など)をそのまま申請書類に反映できるため、手書き転記によるミスが防げます。
メリット③ ペーパーレス・保管コストの削減
紙の書類を印刷・保管する必要がなくなります。電子データとして管理できるため、過去の手続き履歴の検索も容易です。
メリット④ 申請状況のリアルタイム追跡
e-Gov上で申請の受理状況を確認できます。「書類が届いているか不安」「受理されたか確認したい」という問い合わせが減ります。
4. freee電子申請のデメリット・注意点
デメリット① 初期設定に手間がかかる
e-Gov連携の設定や電子証明書の取得・登録には、ある程度の時間と手間がかかります。設定を誤ると申請が通らないケースもあるため、慎重な対応が必要です。

デメリット② マイナンバーの管理が必要
電子申請には従業員のマイナンバーが必要になります。マイナンバーの収集・管理・漏洩防止は法的義務であり、適切なセキュリティ対応が求められます。
デメリット③ エラー対処の知識が必要
申請がエラーになった場合、エラーコードの意味を理解し、修正・再申請を行う必要があります。担当者にある程度のITリテラシーと社会保険の知識が求められます。

デメリット④ すべての手続きが電子申請に対応しているわけではない
一部の手続きは電子申請に未対応であったり、自治体によっては電子申請を受け付けていないケースもあります。紙申請との併用が必要な場面もあります。
5. 電子申請の設定手順(概要)
freeeで電子申請を始めるまでの大まかな流れは以下のとおりです。
- e-Govアカウントの作成(gBizIDプライムの取得が必要)
- freeeとe-Govの連携設定(freee管理画面から操作)
- 電子証明書の取得・登録(必要に応じて)
- 従業員のマイナンバー登録(freee上で管理)
- 試験的な申請を行い、動作確認

設定が完了すれば、以後の手続きはfreee上から申請→e-Gov経由で提出という流れで進みます。
6. 社労士に代行してもらう選択肢
電子申請の設定や日々の手続き対応が難しいと感じる場合は、社労士への代行依頼も有力な選択肢です。
社会保険労務士法人とうかいでは、freeeと連携した社会保険・労働保険手続きの代行サービスを提供しています。入社・退社・扶養変更・算定基礎届・月額変更届など、日々発生する手続きをまとめて対応します。
「設定だけ手伝ってほしい」「手続き代行をまるごと任せたい」など、ご要望に応じた対応が可能です。

よくある質問(FAQ)
Q1. freeeの電子申請はすべての社会保険手続きに対応していますか?
A. すべての手続きに対応しているわけではありません。健康保険・厚生年金・雇用保険の主要な届出には対応していますが、手続きの種類やfreeeのプランによって異なります。最新の対応状況はfreee公式サイトをご確認ください。
Q2. 電子申請を始めるのに費用はかかりますか?
A. e-Gov自体の利用は無料ですが、gBizIDプライムの取得が必要です。また、電子証明書が必要な場合は別途費用が発生することがあります。freeeの契約プランによっても対応範囲が異なります。
Q3. マイナンバーをfreeeで管理することは安全ですか?
A. freeeはマイナンバーの適切な管理機能を備えており、アクセス権限の制御やログ管理が可能です。ただし、社内での運用ルール策定・担当者への教育も必要です。不安な場合は社労士に相談することをおすすめします。
Q4. 社労士に手続き代行を依頼した場合、電子申請もやってもらえますか?
A. はい。社会保険労務士法人とうかいでは、電子申請を活用した手続き代行を行っています。担当者の負担をゼロにしたい場合は、ぜひご相談ください。
社会保険労務士法人とうかいに無料相談する
社会保険労務士法人とうかいは、愛知県・名古屋市を拠点に、freeeを活用した社会保険・労働保険手続きの代行サービスを提供しています。
「電子申請の設定が難しい」「手続きをまとめて任せたい」という方は、まずは無料相談をご利用ください。
社会保険労務士法人とうかい 対応エリア:愛知県全域・東海地区 サービス:freee導入支援・給与計算代行・社会保険労働保険手続き代行
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